Online Tutorials

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Kurse

HPC.NRW organisiert Kurse und Workshops für HPC Nutzende in NRW.

Bezüglich der gezielten Schulung von HPC Nutzenden gingen aus unserer Nutzendenbefragung vor allem Bedarfe an Einführungen in die Bedienung von HPC-Clustern sowie Methoden zu Performance-Profiling und -Optimierung hervor.

Die Online Tutorials und Materialien werden über das HPC-Wiki veröffentlicht.
Darunter zum Beispiel

Introduction to Linux in HPC - Eine Einführung in Linux auf HPC Systemen
OpenMP - Ein verbreitetes Paradigma zur parallelen Programmierung
GPU - Parallele Programmierung unter Verwendung von Grafikkarten
Gprof - Ein profiling Tool für die Bewertung von Anwendungen
TotalView - Debugging von parallelen Anwendungen
Intel VTune - Ein weiteres profiling Tool von Intel

Dort werden außerdem weitere Tutorials und Materialien aus anderen Quellen kuratiert und häufig relevante Themen in Artikeln diskutiert.

Die HPC.NRW Tool Talks Serie befasst einige Software werkzeuge zur Performance Analyse von HPC Anwendungen.

Introduction to Linux in HPC

In dieser umfangreichen, allgemeinen Einführung in Linux geht es in mehreren Teilen um Grundlagenthemen wie die Kommandozeile, die Verzeichnisstruktur, Dateien, Nutzer, Rechte, Prozesse, den VIM Texteditor, Shell-Skripting, Umgebungsvariablen, SSH-Verbindungen und Datentransfers. Die Aufteilung in einzelne Videos ermöglicht es aber auch fortgeschritteneren Nutzenden, einfach und komfortabel noch einmal nachzuschauen, wenn man beispielsweise die Bedienung von VIM vergessen hat.

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Gprof Tutorial

In diesem einteiligen Tutorial geht es speziell um das Thema Performanceanalyse von Anwendungen mit dem GNU Profiler Gprof. Es wird gezeigt, wie man Anwendungen instrumentiert, daraus Performance-Informationen zu einem Anwendungslauf generiert und diese schließlich auswerten kann. Darüber hinaus wird eine Möglichkeit zur Visualisierung der Anwendungsstruktur mittels Call Graphen gegeben und wie man den Quellcode der Anwendung mit Laufzeitinformationen annotieren lassen kann. An drei Realwelt-Beispielen aus den Bereichen Biologie, Informatik und Maschinenbau wird demonstriert, dass dies mit unterschiedlichen Programmiersprachen (z. B. C/C++, Fortran), verschiedenen Compilern (GNU, Intel) und sogar parallelen Anwendungen (Threads, MPI) funktioniert.

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OpenMP in Small Bites

Dieser Kurs richtet sich anfangs an Einsteiger und in späteren Teilen auch an fortgeschrittene Nutzende für die Shared-Memory Parallelisierung von Anwendungen mittels OpenMP Programmierung. Die Konzepte werden dabei häppchenweise in insgesamt 11 Teilen vermittelt und decken die Themen Worksharing, Data Scoping, Tasking und Non-Uniform Memory Access ab.

Folgende Themen werden in diesem Tutorial genauer betrachtet: Überblick, Arbeitsteilung, Daten-Scoping, Falsche Freugabe, Aufgabenstellung, Tasking and Data Scoping, Tasking and Synchronisation, Schleifen und Aufgaben, Aufgabenplanung und uneinheitlicher Speicherzugriff.

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